क�ईंधन कोशिकाओं का सार एक रासायनिक बैटरी है, और हाइड्रोजन ईंधन कोशिकाओं की रूपांतरण दक्षता अपेक्षाकृत कम है। इसकी ऊर्जा मूल से केवल आधी है, और ऊर्जा रूपांतरण दर केवल 50 है। इसका उपयोग किए बिना, यह 50 खो गया है। यदि वाहन चलता है तो रूपांतरण प्रक्रिया लगभग 50% ऊर्जा खो देगी। यानी, बिजली को हाइड्रोजन में बदलना और फिर हाइड्रोजन को बदलना बिजली में। पूरी प्रक्रिया में 75% की हानि होगी, और समग्र रूपांतरण दक्षता अधिक नहीं होगी।
